Annegret Schönbeck studierte Kirchenmusik und Gesang (historische Aufführungspraxis) in Frankfurt am Main sowie Orgel und Gesang an der Schola Cantorum in Basel. Sie arbeitete zunächst als Kantorin in Frankfurt am Main und ist heute Organistin an der Hus-Schnitger-Orgel in der Kirche St. Cosmae et Damiani in Stade.
Seit 2006 leitet sie das von ihr gegründete Projekt „Alte Orgeln für junge Menschen” an der Orgelakademie Stade, zu dessen Programmen auch das Stade Jugendorgelforum gehört. Sie konzertiert im In- und Ausland und wirkte bei Radio- und CD-Produktionen mit, unter anderem mit dem Johann Rosenmüller Ensemble und „La Stagione Frankfurt”.
