Nach dem Studium an den Musikhochschulen Köln und Münster
und an den Universitäten Bonn und Köln konnte sich Karl Kaiser als Solist der Traversflöte, als Kammer- und Orchestermusiker im Bereich der historischen Interpretationspraxis sowie als Lehrer für historische Flöten einen hervorragenden Namen machen.
Karl Kaiser war fast 30 Jahre Soloflötist des Freiburger Barockorchesters. Mit diesem Ensemble hat er über Jahrzehnte in den großen Konzertsälen der Welt die Musik des 18. und 19. Jahrhunderts gespielt. Solo CDs mit Werken von Telemann, Bach, Johann Christian Bach und Wilhelm Friedemann Bach dokumentieren diese Tätigkeit.
Nach vielfältigen weiteren und inspirierenden Erfahrungen mit Solisten, Kammermusikgruppen und Orchestern konzentriert er sich heute auf wenige, sich ergänzende Ensembles.
Karl Kaiser ist Soloflötist von La Stagione Frankfurt unter der Leitung von Michael Schneider und ist auf CDs mit Flötenkonzerten von Telemann, Abel, Graun, Leclair, Vivaldi und Holzbauer zu hören.
Er ist Flötist der Camerata Köln mit weltweiten Konzerten und mit mehr als 50 CDs, die einen großen Teil der barocken und klassischen Kammermusik dokumentieren.
Karl Kaiser ist Flötist des Ardinghello Ensemble für Kammermusik der Klassik und Romantik. CDs erscheinen bei MDG, CPO und Brillant Classics. Selten gespielte Werke von Romberg, Ries, Gyrowetz, Danzi gehören genauso zum Repertoire wie Beethoven und Mozart (Diapason d’Or für die CD mit den Flötenquartetten).
Karl Kaiser war fast 30 Jahre an den Musikhochschulen Frankfurt und Freiburg Professor für historische Flöten. Heute gibt er seine Erfahrungen regelmäßig in Meisterkursen an die junge Generation weiter.
Im Verlag con brio erschien seine Lehrschrift Basiswissen Barockmusik.
Im Verlag Walhall veröffentlichte er 2014 sein Buch Principes de la flûte über die Lehren des Jacques Hotteterre.
Neueditionen ergänzen seine pädagogischen Aktivitäten.